Эпичнейший бред - режиссеры и продюссеры молотки, что не повелись и всё поменяли.
Если восстание плод Матрицы - то в нем тем более нет абсолютно никакого смысла. Люди-батарейки в ванночках живут в своём Сим-Сити, вырабатывают энергию и не жужжат. Зачем им давать этот экшен с Нео?????? Они самодостаточны и довольны в своем мире.
Они в принципе могут что-то узнать о реальном положении вещей только если им кто-то (Мрфеус) сообщит извне, именно взломав Матрицу... Как и поазано в фильме, и полностью логично.
Хотя выдумать связанный реалистичный сюжет в описанном ключе без хеппи-енда тоже не проблема - например, вся движуха была экспериментом с мозгом Нео (изучение реакций на события, либо, допустим, сравнение реакции человека с рассчетом, произведеным заранее).
Или просто приколом скучающего от нечего делать центрального процессора ;)
А круче всего - если бы Нео-таки извлекли из ванны в реальность, и Зион был реальностью, но опять же, по рассчету и с разрешения скучающего ЦП, который в итоге побеждает и говорит типа: Ну ладно, погодим чуток, потом седьмой Зион организуем.