Животный мир Мультинских озер представляют маралы, медведи их пушных зверей соболь. Кстати, очевидцы говорят, что медведя здесь можно встретить запросто, как туриста. Берега озер излюбленное место для водопоя и кормежки лесных животных. В водах озер водятся хариус, голец, сибирский подкаменщик. Хариус поднимается в Мультинские озера на нерест, а осенью скатывается вниз в реки Мульта и Катунь.