Они путешествовали вместе многие годы, пока Эдвард не скончался. Томас очень тяжело переживал кончину отца. Ища утешение в своей работе, он стал практически отшельником, собирая дома внушительную библиотеку и образцы, найденных невиданных созданий. Тем не менее, он нашёл в себе силы вернуться в научный мир. За свою долгую карьеру Томас Мерлин многократно объездил весь земной шар, он дружил и переписывался со многими известными учёными того времени. И, конечно, продолжал собирать свою коллекцию.
Однажды в 1899 году он даже предпринял попытку показать её миру, отправившись в гастроли за океан, в Америку с небольшой частью своей внушительной коллекции. Но местная консервативно настроенная публика резко негативно отнеслась к тем существам, которых показывал им Мерлин. Тур пришлось отменить прежде, чем ему удалось доехать до Калифорнии. Удивительно, но даже в своём почтенном возрасте Сэр Мерлин сохранял потрясающую физическую форму. На вид ему редко давали больше 40 лет. Дошло даже до того, что некоторые начали обвинять его в оккультных практиках, якобы давших ему вечную жизнь.