Изменения уровня воды никоим боком к тому, что Александрия и пр. сейчас находятся под водой. Тектонические движения тому причиной. Про разницу в сто с гаком метров во время последних оледенений - пиздёж.
Дно было отсканировано не одним прибором, куча народу с помощью кучи разного оборудования этим занималось на протяжении кучи лет, информация потихоньку сводилась, и теперь человеки имеют то, что имеют (не сказать что всё дно мирового океана отснято шибко подробно и без косяков).
ТС, для того, чтобы кубатурить над строением и формами рельефа дна, да и суши, стоит начать с изучения общей геологии (учебников полно например на геокниге). Для серьёзного понимания того, почему всё так, нужно будет покурить ещё несколько дисциплин, геоморфологию ту же, геотектонику, и пр.