100 мегатонн - маловато и дальность в 40 км несерьезно как то.
Мня кажется надо делать целую беспилотную подлодку-дебаркадер с зарядом эдак в 2000...3000 мегатонн. Ей просто будет достаточно бабахнуть на максимально близком расстоянии на глубине нескольких сот метров. Можно оснастить аппарат торпедами обычного калибра, но с ядерной начинкой. Для более успешного преодоления ПЛО.
Такую "торпеду" хрен остановишь просто так и сваливать никому никуда не надо.
Вероятный противник, у которого обширная прибрежная инфраструктура, зная о наличии такого оружия возможно немного убавит свои амбиции и аппетиты.