Кларк является вторым ребенком в семье. Ее мать начинала карьеру в качестве секретарши и поднялась в должности до исполнительного директора маркетинговой фирмы. Отец является выходцем из рабочего города Вулверхэмптон, расположенного недалеко от Бирмингема, и работал звукорежиссером мюзиклов.
Эмилия, пойдя по стопам старшего брата, обучалась в Лондонском драматическом центре, который окончила в 2009 году. После его окончания она снималась в паре эпизодов в дневных «мыльных» британских сериалах, а также в рекламе. Она трудилась на нескольких работах, живя с друзьями, прежде чем «Игра престолов» не изменила ее жизнь. В популярном сериале она начала сниматься в 2011 году с самого первого эпизода.
Кларк призналась, что испытывала некоторые трудности на ранней стадии съемок. Ей было 23 года. У нее было много обнаженных сцен, ей пришлось сняться в сцене изнасилования. Актриса рассказывала Марковицу, как страдала вместе со своей героиней, иногда на съемках срываясь на крик. Начиная с четвертого сезона, Кларк отказалась сниматься обнаженной и ее заменила дублерша, которая, в свою очередь недавно призналась, что покидает сериал. У поклонников саги это породило версию о том, что героиня Кларк будет убита в следующем эпизоде. За роль Таргариен Эмилия Кларк получила премию EWwy Award журнала Entertainment Weekly в категории «Лучшая драматическая актриса второго плана». В 2013 году актриса перенесла разрыв аневризмы сосудов головного мозга прямо после одного из спектаклей на Бродвее. Свою личную жизнь британская актриса, много времени проводящая в США, тщательно скрывает.
"Сексуальная, но по-прежнему реальная, — заключает автор статьи об актрисе, — этот великолепный баланс называется Эмилия Кларк".
yaplakal.com