У аналоговой системотехники, тоже недостатков хватает - любая аналоговая схема после сборки требует настройки (токи, напряжения, и т.д.). На "аналоге" очень трудно сделать многофункциональное устройство.
Нужно чуток изменить логику работы - перепаивай!, а то и печатную плату заново разводи... А не просто новую прошивку залил-и готово...
А у микроконтроллеров "ахиллесова пята" - их компактность. Чем меньше размеры электронных компонентов (транзисторов в микросхеме), тем меньше они к радиации устойчивы...
Самые устойчивая элементная база - радиолампы. Но размеры... энергопотребление... нагрев... вибростойкость...