Все просто.
Березовский считал себя выше и попытался командовать Путиным, давать ему указания.
Не получилось, - начал действовать через канал СМИ (1 канал). А Путин очень ранимый и обидчивый. Особенно задела его критика по каналу Березовского по вопросу Курска. Это и было критической точкой.
Это вообще для него больной вопрос, потому что он повел себя некомпетентно.
Чубайс же очевидно подчинился.