Каждое оружие имеет свои цели и специфику применения. В каждом конкретном случае она своя.
Для бармалеев достаточно самолётов и крылатых ракет. Расматривая конкретно этот случай - сбить данную ракету НЕВОЗМОЖНО. И не важно что там могут ПРО и ПВО в других условиях.
Для других специфических задач, если у противника имеется ПРО - будут использовать другой тип ракет и другие места базирования.
Говорить о том, что ракета легко сбивается - глупо. В Сирии её некому сбивать. А когда опасность появится - сменят тип ракет в соответствии с этой опасностью.