Ты бы, ТС, схемку нарисовал как у тебя там что устроено и выложил сюда. А то со слов не очень понятно.
Явно проблема в роутинге. Причем, не факт, что проблема на Микротике. Микрот все свои сети видит сразу, если они корректно прописаны и пуляет туда пакеты по умолчанию.
А вот с обратной стороны, например, о подсетках Микротика могут не знать от слова "совсем", поэтому ответа на пакеты не приходит.