Здравствуйте, господа!
Тоже столкнулся с проблемой почистить винт
Чтобы новая ось встала на чистый диск
Помог загрузочный диск с ms dos и disk editor
Забил нулями секторы начиная с нулвого и далее пока
точки не начались (обычно 1-2 сектора по 512 байт)
Еще fat замочил, секторы не помню точно, примерно с 60 до 70
И всё винт считаеися чистым